醫(yī)院污水處理是指處理醫(yī)院排放的污水的處理方式。醫(yī)院的污水，除一般生活污水外，還含有化學(xué)物質(zhì)、放射性廢水和病原體。因此，經(jīng)過(guò)處理后才能排放，特別是肝炎等傳染病病房排出來(lái)的污水，須經(jīng)消毒后才可排放。無(wú)集中式污水處理設(shè)備的醫(yī)院，對(duì)有傳染性的糞便，單消毒使其無(wú)害化。常用消毒劑有二氧化氯、漂白粉、液氯、次氯酸鈉、臭氧。對(duì)含放射性同位素的污水，應(yīng)按同位素處理要求處理。醫(yī)院污水在處理過(guò)程中，沉淀的污泥含有大量的細(xì)菌、病毒和寄生蟲卵，須經(jīng)消毒（常用熟石灰消毒）或高溫堆肥后方可用作肥料。

醫(yī)用污水處理的原則是：分質(zhì)分流，局部分隔治理，把污染就近消滅在污染源。主要處理方法為沉淀與消毒。我國(guó)常用的消毒劑為液氯，近年來(lái)，為了提高消毒效率及不產(chǎn)生二次污染多趨向采用臭氧化法消毒，消毒處理后均可達(dá)到排放標(biāo)準(zhǔn)。處理過(guò)程中產(chǎn)生的污泥常采用石灰消毒法及高溫堆肥法進(jìn)行處理。

根據(jù)國(guó)家環(huán)?？偩值挠嘘P(guān)規(guī)定（國(guó)家環(huán)?？偩?醫(yī)院污水處理技術(shù)指南.2003.12（環(huán)發(fā)（2003）197號(hào) ），將各類醫(yī)院按性質(zhì)分為綜合醫(yī)院和傳染病醫(yī)院兩類，與衛(wèi)生系統(tǒng)對(duì)醫(yī)院及醫(yī)療機(jī)構(gòu)的劃分方法有差別。其中傳染病醫(yī)院指?jìng)魅拘约膊？漆t(yī)院和帶傳染病房的綜合醫(yī)院，綜合醫(yī)院為不帶傳染病房的綜合醫(yī)院和各類非傳染性疾病的專科醫(yī)院。醫(yī)院污水凈化包括綜合醫(yī)院、中醫(yī)醫(yī)院、中西醫(yī)結(jié)合醫(yī)院、民族醫(yī)院和專科醫(yī)院（傳染病醫(yī)院（包括結(jié)核病院）、心血管病醫(yī)院、腫瘤醫(yī)院、口腔醫(yī)院、婦產(chǎn)科醫(yī)院和精神病醫(yī)院等等）各類醫(yī)院污水的處理，同時(shí)也包括療養(yǎng)院、康復(fù)醫(yī)院等其它醫(yī)療機(jī)構(gòu)和獸醫(yī)院的污水處理工程。